家賃収入には、消費税が課税されるものと課税されないものがあるのですか？

貸家の家賃収入については、居住用として使用されているものは非課税で、居住用以外に使用されているものは課税です。
ですから、個人に貸すか、会社に貸すか。課税事業者に貸すか、非課税事業者に貸すか。等は問題ではなく、その貸家がどのように利用されているかによって、消費税が非課税であるか課税されるかが決まります。
アパート、マンション等の家賃は非課税で、貸店舗、貸倉庫等の家賃は課税となります。